与其他手术样，腹腔镜手术也有和手术的潜在风险。尽管腹腔镜手术比传统的开放手术组织损伤更少，但并不意味着它完全没有风险。随着手术部位的不同，手术的并发症也不尽相同。由于气腹可能会引起心律失常，皮下气肿等并发症;置放穿刺套管及手术操作时可能会引起空腔脏器的穿孔，实质性脏器的破裂及出血等并发症。但在绝大多数的报道中，腹腔镜手术的并发症发生率都很低，在1-5%之间，术后死亡率大约在0.%。